La Constitution de 1992 établit un régime parlementaire monocaméral. Le parlement (Riigikogu) dispose de pouvoirs étendus. Il comprend 101 députés élus au suffrage universel direct pour quatre ans.

Le Président de la République est élu pour cinq ans, par le Parlement, ou au deuxième tour par un collège électoral auquel se joignent des élus locaux. Son pouvoir politique est restreint, mais il exerce un magistère important justifiant des interventions dans la vie politique.

Le Président de la République et le Parlement concourent à la nomination du gouvernement. Celui-ci est responsable devant le Parlement, mais il est de fait étroitement placé sous sa dépendance par le biais du contrôle des commissions et de la procédure législative qui fixe le rythme de l'action gouvernementale.

L'actuel président de l'Estonie est M. Thomas Hendrik ILVES.